在物質代謝途徑的研究中，微生物也常被利用。從上面的敘述可以看出，在物質代謝的研究中，就使用的材料而言，是由完整動物逐漸發展到純酶。

　　隨著研究方法的發展，物質代謝的途徑逐漸為人們所了解。

　　生物體從環境中攝取的營養素，以糖、脂類、蛋白質、核酸等為最多。進入體內后，各自進入其代謝途徑。一個代謝途徑是由許多化學反應有組織、有次序地一個接一個的發生和完成，絕大多數的反應都是在較溫和的溫度、pH及離子濃度條件下，由酶促進，以非常高的速度進行。每一酶促反應幾乎都是由一特異的酶所催化，而許多酶還有其必需的輔助因子。例如，進入體內的營養素“甲”，在其代謝途徑中，將轉變為中間產物“乙、丙、丁…”一直到最終產物“癸”，可圖示如下：

　　酶1酶2酶3

　　甲--→乙--→丙--→丁……癸

　　輔1輔2輔3

　　圖中酶1、酶2、酶3等代表促進每一步驟特異的酶，而輔1、輔2、輔3等為每一種酶所需要的輔助因子。這可用實例說明，一個成年人食進多于其一切活動所需要的食物時，往往會發胖，這顯然是體內將多余的食物儲存為脂肪，亦即脂肪酸的合成增多。脂肪酸的合成與蛋白質、核酸及糖類等相比，較為簡單;所用原料為乙酸，但必須以其活潑衍生物，乙酰輔酶A的形式，進入代謝途徑。乙酰輔酶A在體內，來源甚廣，主要食物，如糖類、脂類及蛋白質等在分解代謝中，均可生成乙酰輔酶A。在其進入脂肪酸合成途徑之前，必須由酰基轉移酶催化，先與脂肪酰載體蛋白結合，然后再兩個碳原子兩個碳原子加上去，而每加上兩個碳原子，包括從乙酰輔酶A合成的主要原料丙二酸單酰輔酶A在內，須經七個步驟，需要七種不同的酶及三種不同的輔助因子。在乙酰輔酶A上，七次加上兩個碳原子(實際是丙二酸單酰輔酶A)之后，還須有軟脂酰脫酰酶的催化作用，才能完成一分子軟脂酸的合成。這一代謝途徑可用作合成主要偶數脂肪酸的例子，由于許多化學反應不僅是進行性的、逐步的，而且還是分階段來完成的，足見其復雜性。

　　代謝途徑的復雜性還表現在一種物質在體內可進入多種代謝途徑，可進入合成代謝途徑，也可進入分解代謝途徑，有的即使是合成代謝抑或是分解代謝，其途徑也不只一種。例如乙酰輔酶A不僅可進入三羧酸循環而被氧化以產生能量，而且在合成代謝方面，除合成脂肪酸之外，還是酮體及固醇類物質分子中碳原子的主要來源，也是合成一些氨基酸，如谷氨酸以及微生物體內精氨酸、賴氨酸等的一種原料。此外，乙酰輔酶A在乙酰化作用中起著廣泛的作用，如在乙酰氨基糖、乙酰膽堿、乙酰肉毒堿等的生成中。

　　總結：近代技術和儀器的發展不但能定位、分離、提純、追蹤、鑒別及測定代謝物及其產物，而且還能對參加物質代謝中生物分子的組成、結構、構型、構象及其各種性質等加以研究，而所得結果往往有可能用以解釋或確定其在物質代謝中的功能。

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